Traitement de charpente - agrément des entreprises

Je suis un particulier et je souhaite faire traiter ma charpente (attaquée par vrillette et capricorne) par un professionnel. Une amie architecte me dit qu'il ne faut faire intervenir que des entreprises ayant reçu l'agrément du ministère de l'agriculture. Or, la plupart des entreprises n'ont pas cet agrément. Quels sont les risques que je prends avec une entreprise non agréée et quelles garanties me sont apportées ?
Merci